Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms