Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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