Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Slc6a20aQ8VDB9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Slc6a20aQ8VDB9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Slc6a20aQ8VDB9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Slc6a20aQ8VDB9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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