Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms