Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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