Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop1Q8K205 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop1Q8K205 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms