Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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