Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms