Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SbsnQ8CIT9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms