Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrif1Q8CDD9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms