Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf31Q8CCF0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms