Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms