Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Chd9Q8BYH8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd9Q8BYH8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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