Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTH8

Csnk1g1, Casein kinase I isoform gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g1Q8BTH8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Csnk1g1Q8BTH8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Csnk1g1Q8BTH8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1g1Q8BTH8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Csnk1g1Q8BTH8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Csnk1g1Q8BTH8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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