Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms