Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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