Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm4Q80XG9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm4Q80XG9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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