Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll4Q80UG8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll4Q80UG8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll4Q80UG8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll4Q80UG8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll4Q80UG8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll4Q80UG8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms