Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim12Q78RX3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms