Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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