Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd3eapQ76KJ5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms