Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cnih3Q6ZWS4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cnih3Q6ZWS4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms