Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms