Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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