Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms