Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms