Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nop58Q6DFW4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nop58Q6DFW4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nop58Q6DFW4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nop58Q6DFW4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nop58Q6DFW4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms