Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrcc1Q69ZB0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrcc1Q69ZB0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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