Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ss18Q62280 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ss18Q62280 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ss18Q62280 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ss18Q62280 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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