Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prkd1Q62101 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prkd1Q62101 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms