Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApcQ61315 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApcQ61315 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms