Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Trim58Q5NCC9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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