Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim41Q5NCC3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim41Q5NCC3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms