Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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