Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1nQ497L1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms