Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms