Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms