Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms