Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim80Q3V061 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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