Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms