Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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