Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms