Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms