Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms