Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39dQ0VF76 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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