Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms