Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms