Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700061G19RikQ08EE8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms