Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINDOCQ05AH6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms