Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms